当センターは、（１）国際交流基金本部事業の実施、（２）日本文化発信や交流活動に資する当センター独自の事業の実施、（３）外部団体への支援・協力、（４）調査及び情報収集・提供活動の４種類の活動を主に行っています。
（１）国際交流基金本部事業の実施
国際交流基金本部が実施する各種事業（文化芸術交流、日本語教育、日本研究・知的交流、アジアセンター事業）の現地での受入・調整業務と、インドネシア人文化人・知識人・研究者等の日本招聘に係る各種業務を実施しています。
（２）日本文化発信や交流活動に資する当センター独自の事業の実施
海外事務所主催事業として、当センターの施設及び外部施設を活用しながら、講演会、展覧会、映画上映会、茶道や華道などの教室事業、文化備品貸出など、日本の文化芸術の紹介や日イの人的交流に資する事業、日本語講座を企画・実施しています。
（３）外部団体への支援・協力
文化芸術、日本語教育、日本研究・知的交流の各分野において、外部団体が主催する事業に対し、共催者としての各種協力（一部資金負担、広報協力、備品貸出、後援名義付与等）を実施。
（４）調査及び情報収集・提供活動、他
現地機関の協力を得ながら、日本語教育・日本研究機関調査などの調査を実施。また文化交流事業に関連して、日本及びインドネシアからの各種照会に対応しています。また中学・高校生等訪問（スクール・ビジット）を受け入れており、年間1,000名の学生が当センターを来訪している。
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